История чихуахуа вызывает недоумение и есть много теорий, окружающих тайной происхождение этой породы собак. Фольклор и археологические находки свидетельствуют о том, что порода произошла в Мексике. Наиболее распространенной и наиболее вероятной теорией происхождения Чихуахуа является та, что утверждает о том, что чихуахуа произошли от Techichi, собаки-компаньона благоприятствовавшей цивилизации тольтеков в Мексике. Нет упоминаний о Techichi вплоть до 9-го века, хотя собаки были найдены в горшках гробниц Колима в Мексика. Вполне вероятно, что собаки появились раньше племени майя, как собак приближеным к высшим чинам, чихуахуа можно встретить в материалах о Великой пирамиде Чолула, предшествовавшей 1530г и в развалинах Чичен-Ица ​​на полуострове Юкатан. На самом деле, карманные собаки игрушки, изображающиеся как «голова оленя» породы чихуахуа были обнаружены по всей Центральной Америке, от Мексики до Сальвадора. Самые ранние из них были найдены в Сапотес Tres в Веракрус, Мексике, и датированы 100 г. н.э. Горшки из гробницы с мумифицированными собаками, датируются приблизительно 1325 г. н.э. и обнаружены в Грузии, Теннесси и также, представляют собой чихуахуа. Родоначальника породы нашли в 1850 году в старых руинах около Casas Grandes в мексиканском штате Чиуауа, от которого порода получила свое название, хотя большинство артефактов, связанных с его существованием находятся вокруг Мехико. Горшки с изображением "головы оленя" были обнаружены в Casas Grandes которые датируется 1100-1300 н.э. Чихуахуа остается неизменно популярной, как порода, в частности, в Америке, и была впервые признана Американским клубом собаководства в 1904 году.